A clientela da FAPEMIG é constituída por instituições sediadas em Minas Gerais ou pesquisadores que com elas mantenham vínculo permanente ou temporário que se enquadram em uma das seguintes categorias:

I. Institutos de pesquisa federais ou estaduais;
II. Universidades e instituições de ensino superior federais, estaduais e municipais que executam atividades de pesquisa científica ou tecnológica;
III. Instituições privadas de ensino superior, sem fins lucrativos, que realizam atividades de pesquisa científica ou tecnológica;
IV. Órgãos da administração direta do Governo do Estado de Minas Gerais, voltados ao desenvolvimento de atividades de pesquisa científica e ou tecnológica;
V. Outros órgãos da administração direta e indireta do Governo do Estado que desenvolvam projetos de pesquisa científica e ou tecnológica;
VI. Entidades associativas, sem fins lucrativos, cujos objetivos estejam voltados `a promoção do desenvolvimento científico e tecnológico;
VII. Empresas privadas, incubadoras de empresas e parques tecnológicos, atendendo a editais específicos, publicados pela FAPEMIG, definindo, em cada caso, as normas de cooperação;
VIII. Pesquisadores individuais que mantenham vínculo formal, de caráter permanente ou temporário, com institutos de pesquisa ou instituições de ensino e pesquisa.

Nem todas as modalidades de atuação da FAPEMIG, se aplicam a todas as categorias de instituições-clientes. É necessário verificar, para cada modalidade, quais as categorias podem dela se beneficiar. A concessão de auxílio está subordinada à comprovação objetiva da capacitação do proponente para executar as atividades para as quais venha solicitar o apoio financeiro.